选择血液透析方法时，应考虑年龄、原发疾病、并发症、血管状况和预期的治疗效果。血液透析不适合心脏功能差、不能活动或瘫痪的患者。婴儿血液透析通常难以持续，并影响生长发育。应该选择腹部透析。血液透析不适用于精神病患者或老年痴呆症和急性脑血管病患者。血液透析不适用于肝肾综合征和晚期肝硬化患者。
一般情况下，并不存在“血液透析中三大并发症”这种说法。血液透析在治疗过程中可能会出现多种并发症。
1. 高血压：血液透析中高血压的发生可能与尿毒症患者体内水钠潴留导致容量负荷增加有关。血液透析过程中体内的钙离子浓度变化也可能导致神经肌肉兴奋性增强，引起血压升高。贫血状态也会通过激活肾素血管紧张素-醛固酮系统来刺激血压升高。
2. 心力衰竭：心力衰竭是由于心脏无法有效泵血而导致血液循环障碍。在血液透析过程中，为了满足身体需要，心脏可能会通过提高血压来保证足够的血液供应，但长期下来会导致心脏功能下降，心脏射血量减少，引发心力衰竭。
3.失衡综合征：多发生在首次或长时间未透析后重新开始透析的患者身上，表现为头痛、恶心、呕吐、抽搐甚至昏迷。这主要是由于快速清除体内毒素和水分，导致脑细胞内外渗透压不平衡所致。
4.感染：包括透析通路感染、菌血症等，是长期透析患者的重要并发症之一。感染源可能来自透析器、管路、透析液污染或是患者自身皮肤、血管通路等。