脱肛在治疗时，如果病情比较轻微，一般是能够自行回纳的，也可以在医生指导下使用痔疮膏或痔疮栓剂进行治疗，或用温水或高锰酸钾液坐浴。如果病情比较严重，可通过腹腔镜进行直肠固定术，或肛门环缩术等手术治疗。平时要多吃富含维生素食物，保持肛周清洁卫生，防止感染。
治疗脱肛需根据患者年龄、病情严重程度等因素综合考虑。对幼儿，常采用保守治疗，如手法复位外固定，通过按揉将脱出肛门外的直肠黏膜复位并固定，同时注重改善排便习惯，减少腹内压增高的因素。对成人，尤其是黏膜脱垂，可采用硬化剂注射治疗，使黏膜与肌层粘连固定。若成人出现完全性直肠脱垂，则主要考虑手术治疗，如直肠悬吊固定术等，以恢复直肠正常位置并防止复发。
药物治疗如迈之灵、地奥司明等可辅助减轻局部组织水肿，改善症状。若患者出现身体不适症状严重，建议及时就医。