通过手术治疗，关于极少数轻度的脱肛患者，能够采取吻合器痔上黏膜环形切除，也就是直肠黏膜环形切除可以起到缓解症状的作用，而对于大多数，中重度的，直肠粘膜脱垂，通常需要盆底肌加固直肠悬吊。根据目前的治疗通常采用补片悬吊的方法。
治疗脱肛需根据患者年龄、病情严重程度等因素综合考虑。对幼儿，常采用保守治疗，如手法复位外固定，通过按揉将脱出肛门外的直肠黏膜复位并固定，同时注重改善排便习惯，减少腹内压增高的因素。对成人，尤其是黏膜脱垂，可采用硬化剂注射治疗，使黏膜与肌层粘连固定。若成人出现完全性直肠脱垂，则主要考虑手术治疗，如直肠悬吊固定术等，以恢复直肠正常位置并防止复发。
药物治疗如迈之灵、地奥司明等可辅助减轻局部组织水肿，改善症状。若患者出现身体不适症状严重，建议及时就医。