JE可直接抑制患者的呼吸中枢，导致昏迷和呼吸抑制，从而导致呼吸浅而慢，有的甚至呼吸停止。JE可引起患者的一系列精神症状，包括神经障碍，如轻瘫、偏瘫、四肢或和运动障碍。因此，JE可引起患者中枢性呼吸衰竭，此类患者在积极抗病毒治疗的同时，需要进行呼吸机辅助通气治疗。
左心衰竭所引发的呼吸困难，在于心肌收缩力的减退。当左心无法充分泵送血液至主动脉时，左心室与左心房内血液积聚，压力骤升，这一变化直接干扰了肺部的血液循环。
肺部血液循环受阻，导致血液在肺内淤积，进而诱发肺水肿，即液体异常渗入肺泡间质与肺泡腔内。肺水肿的形成严重阻碍了肺部的气体交换过程，使得氧气难以有效弥散入血，同时二氧化碳也无法顺利排出，从而造成呼吸困难与气促等症状的显现。
在体力活动或采取平卧位时，由于体循环回心血量的增加，肺循环的淤血状况进一步加剧，呼吸困难的症状也随之变得更加显著。此外，左心衰竭诱发的肺淤血与水肿，直接削弱了肺部的气体交换效能，进一步加剧了缺氧与二氧化碳潴留的状况，使得呼吸困难成为患者最为突出的临床表现。