药物流产是会有一定的疼痛感的。药物流产的服药时间为3天，前两天早晚服用米非司酮，第三天服用米索前列醇，一般情况下前两天没有特殊感觉，第三天服药完了以后，会出现比较剧烈的疼痛，当然也有个别人反应并不是很明显。具体的疼痛程度因人而异。一般来说，这种疼痛大多数人都可以忍受，而且随着时间的推移，疼痛会逐渐减轻。
药物流产的危害主要体现在身体和心理两方面。
身体方面，药物流产可能导致月经紊乱，出现月经周期延长或缩短、经量增多或减少等不规律现象。此外，药物流产还可能引起不完全流产，导致胚胎组织残留，需要进一步的刮宫处理，这不仅增加了疼痛和感染的风险，还可能对子宫内膜造成二次创伤，甚至诱发盆腔炎、腹膜炎等炎症，严重时可能导致不孕或习惯性流产。同时，药物流产还可能导致贫血、子宫腔粘连、失血性休克等严重后果。心理方面，药物流产可能给女性带来心理压力和负担，影响其身心健康。
因此，女性在选择药物流产时应充分了解其潜在危害，并在医生的指导下进行，同时做好术后的护理和复查工作，以减少对身体的伤害。同时，也应强调避孕的重要性，以避免不必要的流产对身体造成损害。