孕早期总感觉肚子不舒服可能是体内激素水平变化、饮食因素、着凉，以及胃肠疾病等原因引起。1、体内激素水平变化：孕早期体内激素水平发生变化，容易出现恶心、呕吐、腹胀等症状，会出现肚子不舒服。2、饮食因素：如果饮食经常吃凉的、辣的、油腻的食物，容易加重胃肠负担，导致肠蠕动增快也会出现肚子不舒服，严重者还有可能出现腹痛、腹泻的情况。3、着凉：在孕早期的时候，如果没有做好保暖、着凉，也会出现肚子不舒服。4、胃肠疾病：在孕早期的时候如果患有胃炎、肠炎或者胃溃疡，也会出现肚子不舒服。如果长时间不缓解或者症状比较严重，需要及时去医院检查，观察是哪种原因引起。