5岁孩子肚子疼可能是生理性因素、饮食不当、急性胃肠炎、肠系膜淋巴结炎以及急性阑尾炎等导致。1、可能与生理性肠痉挛有关，症状比较轻微，可以暂时观察，可以自愈。2、饮食不当，容易增加胃肠道负担，出现肚子疼的情况，主要是呈阵发性疼痛，建议及时纠正不当饮食。3、可能与急性胃肠炎以及急性肠系膜淋巴结炎有关，导致肠道功能紊乱以及菌群失调，出现肚子疼，伴有有腹泻、呕吐等症状，建议在医师指导下使用肠道益生菌调节肠道菌群，比如复方嗜酸乳杆菌片、地衣芽孢杆菌活菌胶囊等。4、急性阑尾炎。如果孩子出现持续性肚子疼，需要警惕急性阑尾炎，及时就医。