小孩甲流高烧39度不退，可以通过物理降温和药物治疗等方法。家长可以用湿毛巾和退热贴等方式帮助孩子降温，也可以在医生的指导下使用抗病毒药物磷酸奥司他韦颗粒和退烧药物布洛芬、对乙酰氨基酚等来治疗。若孩子持续发热，体温不降，家长应及时带孩子前往医院就诊，以免耽误病情。
面对小孩高烧至39度的情况，家长应保持冷静，采取科学合理的降温措施：
1.药物降温：
在医生指导下给予适量的退热药物，如对乙酰氨基酚（宝宝2月以上适用）或布洛芬（宝宝6月以上适用）。遵医嘱或按说明书上的剂量服用药物能够迅速使体温降低。若反复发热，4-6小时后再一次服用退热药物。
2.物理降温：
使用温水擦浴或冷敷额头、腋下和大腿根部，帮助孩子散热。也可以用温水给孩子洗澡，但不要使用冷水，防止导致寒战。在孩子能够配合的前提下，通过物理降温的同时也可以使用药物降温。
3.补充水分：
孩子会在发热期间大量出汗，鼓励孩子多饮水，补充体液，预防脱水。
4.及时就医：
采取药物与物理降温双重措施的同时，及时带孩子前往医院就诊，诊断发热的病因并实施治疗。
按照以上措施行动，基本能够有效地降低孩子的体温。若高烧持续不退，或伴有呼吸困难、皮疹、抽搐等症状，应立即就医。