腰两侧肌肉疼痛的原因可能包括以下几点：
1.不良姿势：长期弯腰拾物、久坐、久站或久躺等不良生活、工作姿势，可能导致腰部肌肉慢性劳损。
2.腰椎问题：如腰椎间盘突出，可能压迫支配腰部肌肉的神经，引发疼痛。
3.特定生理状况：女性孕期或经期，由于身体变化，可能引起腰部肌肉酸痛。
4.疾病因素：泌尿系统疾病（如输尿管结石、肾结石）或全身感染性疾病等也可能导致腰两侧肌肉疼痛。
5.其他原因：夜间受凉导致肌肉痉挛，或高强度锻炼后乳酸堆积等，也可能引起疼痛。
建议出现腰两侧肌肉疼痛时，及时就医以明确病因并采取相应治疗措施。
